2015年12月30日，宇宙探索船Luxion船長，高屋法子的父親在宇宙中過世。少女高屋法子立誌成為像爸爸壹樣的宇宙駕駛員，並為之奮鬥。

6年後，高屋法子成為了中學生。學校開設了機器人駕駛的課程。三年級的天野和美學姐駕駛技術高超、受人愛戴，被低年級學生稱為“姐姐”。新來的教練太田先生來到學校，要挑選2名學生成為宇宙駕駛員。“姐姐”毫無懸念的入選，但缺少機器人駕駛經驗的高屋法子竟然也入選了宇宙駕駛員！

伴隨著興奮與疑惑，高屋法子開始了宇宙駕駛員的生活，但是令她始料未及的是，她的任務是駕駛機器人，與害死父親的外星生物戰鬥。關系人類存亡的戰鬥責任，突然降臨在少女高屋法子的身上，她的未來將如何譜寫？

21世紀人類開始開發宇宙。但是受到宇宙生物群（通稱宇宙怪獸，STMC）：壹種以恒星作載體繁殖的生物來襲，使人類文明受到重大威脅。為了對抗宇宙怪獸，人類持續開發機器人兵器和宇宙戰艦，由地球上的機器人訓練學校找出優勝的駕駛員控制。

2015年，在人類史上第壹次和宇宙怪獸接觸後，故事的女主角高屋法子進入了機器人訓練學校接受訓練，駕駛對抗宇宙怪獸最強武器：Gunbuster，開始了她守護地球使命的故事